Lo Statuto di ENAV prevede che il Consiglio di Amministrazione sia composto da un minimo di 5 a un massimo di 9 componenti. Il numero esatto dei componenti del Consiglio di Amministrazione è determinato dall'Assemblea ordinaria degli Azionisti nel rispetto dei limiti previsti dallo Statuto. L'Assemblea degli Azionisti tenutasi il 21 maggio 2020 ha deliberato di fissare in nove il numero dei componenti il Consiglio di Amministrazione.

Ai sensi dell'art. 11-bis.3 dello Statuto, il Consiglio di Amministrazione è nominato dall'Assemblea sulla base di liste presentate dagli azionisti, nel rispetto dell'applicabile normativa, anche in materia di equilibrio tra i generi.
 
L'assunzione della carica di amministratore è subordinata al possesso dei requisiti di onorabilità e professionalità previsti dalla legge, dalle disposizioni regolamentari vigenti e dall'art. 11-bis.1 dello Statuto. Ai sensi dell'art. 11-bis.2 dello Statuto, la composizione del Consiglio di Amministrazione deve altresì garantire la presenza di un numero di amministratori indipendenti non inferiore a quello previsto dalla applicabile normativa.
 
L'Assemblea degli azionisti tenutasi il 21 maggio 2020 ha nominato il Consiglio di Amministrazione per il triennio 2020-2022 nelle persone di Francesca Isgrò, in qualità di Presidente e di Paolo Simioni, Angela Stefania Bergantino, Laura Cavallo, Giuseppe Lorubio, Fabiola Mascardi, Fabio Pammolli, Carlo Paris e Antonio Santi.