La corporate governance di ENAV assicura la gestione efficace ed efficiente dell'impresa, con l'obiettivo di creare valore per gli azionisti nel medio-lungo periodo, tenendo conto degli interessi degli altri stakeholders.
Il modello di amministrazione e controllo della Società è definito alla stregua dell'applicabile normativa generale e speciale tenendo conto dei principi e delle raccomandazioni contenuti nel Codice di Autodisciplina delle Società Quotate cui la Società aderisce nonché delle best practice in materia.

La governance di ENAV si basa sul modello tradizionale, caratterizzato dalla dicotomia tra Consiglio di Amministrazione e Collegio Sindacale, entrambi di nomina assembleare. La revisione legale è affidata ad una società di revisione. La gestione finanziaria della Società è sottoposta al controllo della Corte dei conti (legge 21 marzo 1958, n. 259), tramite un Magistrato delegato della Corte dei conti, che assiste alle sedute del Consiglio di Amministrazione e del Collegio Sindacale.      
 
L'Assemblea degli Azionisti ha il compito di prendere le decisioni più rilevanti per la vita della Società, fra cui nominare e revocare i componenti del Consiglio di Amministrazione e del Collegio Sindacale e i relativi Presidenti, nonché la società di revisione, prevedendone i compensi. Inoltre, l'Assemblea degli Azionisti approva il bilancio e delibera sulle modifiche statutarie e sulle operazioni di carattere straordinario, quali aumenti di capitale, fusioni e scissioni.
Il Consiglio di Amministrazione in carica è composto da 9 membri e si riunisce di regola ogni mese per esaminare e deliberare in merito all'andamento della gestione, ai risultati consuntivi, alle proposte relative al modello organizzativo e ad operazioni di rilevanza strategica, nonché alle materie riservate alla competenza del Consiglio stesso. In conformità a quanto disposto dal Codice Civile, esso ha delegato parte delle proprie competenze gestionali all'Amministratore Delegato. I ruoli di Amministratore Delegato e Presidente risultano separati e ad entrambi compete la rappresentanza della Società.

Ai sensi dello Statuto, il Collegio Sindacale è costituito da 3 membri effettivi e 2 membri supplenti. Vigila sull'osservanza della Legge e dello Statuto, sul rispetto dei principi di corretta amministrazione e in particolare sull'adeguatezza dell'assetto organizzativo, amministrativo e contabile adottato dalla Società e sul suo concreto funzionamento.

Relazione sul Governo Societario e gli Assetti Proprietari 2019